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Estudios de epigenómica
El coste y tiempo requerido dependerá del proyecto a ejecutar.
Estudio epigenético tanto del genoma completo como de regiones específicas del ADN mediante secuenciación masiva.
Especificaciones técnicas:
La secuenciacón masiva se realizara en en la plataforma Illumina, con el equipo NextSeq 2000, donde se obtienen lecturas cortas de los fragmentos de una forma muy fiable. Se podrán hacer diferentes abordajes dependiendo de las necesidades del cliente (ataq-seq, cut and run, Whole Genome Bisulpgite Sequencing, Chip-Seq.)
Alcance del servicio:
Se podrá realizar desde el diseño experimenal hasta el análisis final de datos. También es posible realizar únicamente el análisis de las muestras.
Requisitos de las muestras:
Dependiendo del tipo de muestra a analizar y la finalidad del estudio, se requiere una cantidad de muestra diferente así como la idoneidad de realizar duplicados (a consultar). Las muestras siempre han de estar congeladas.
Proceso que implica el servicio:
Se extrae el ADN de las muestras utilizando kits comerciales y se generan las diferentes librerías para la secuenciación según el análisis que interesa con un protocolo específico. Las muestras están etiquetadas individualmente con códigos de barras y adaptadores específicos del equipo. Todas las muestras se secuencian a la vez agrupándolas en una concentración equimolar para la secuenciación.
Finalidad:
Investigación y Desarrollo
Monto:
El coste y tiempo requerido dependerá del proyecto a ejecutar.
Plazos:
A definir en cada caso.
Output del servicio:
Documentos digitales como los fastq generados y diferentes gráficos si se ha requerido del análisis de los datos. Todo ello se acompaña del informe de resultados donde se describe todo el estudio realizado.